柏林系统

在德国的 Peter Wilkens 先生在 1970 年代发明了这种系统。缸内没有底沙只依赖活礁石为生物过滤，泡沫过滤为物理过滤，活性炭为化学过滤。他也推荐使用石灰水来提高酸碱度、碱性和钙质。
不过大约在五六十年代在印尼的 Lee Chin Eng 先生已经开始运用活礁石在海水缸了，只是当时他并没有像 Peter Wilkens 先生那样留下详细的研究报告。而当时泡沫蒸馏也还没有被运用在水族箱里，只用风石在缸内打气。

摩纳哥/充水层系统

由 Jean Jaubert 发明的系统，在水族箱的底部制造一个微氧区，饲养厌氧菌来减低系统内硝酸盐的堆积。
首先在缸底用几块约1~2寸高 PVC管切成的垫块把一片朔胶格子灯罩（也可以用过滤盘）托住，铺上一层纤维或 PVC网，然后将体积1~3毫米的活沙铺至大约1~2寸的厚度，活沙上再铺上一层网以防钻沙动物干扰沙层，最后铺上也是大约1~2寸的霰沙。底沙层如果是用经过处理的干珊瑚沙，开缸时则要从别个成熟水族箱的底沙接种过来。
活礁石也被用在这种系统里。起初 Jean Jaubert 并不推荐使用泡沫蒸馏，但在后来他改变了主意，几年后在美国的 Larry Jackson 和一些海水系统爱好者对这种系统作了一些改变，只铺一层2~3寸的活沙而不用充水层，成了厚底沙过滤系统。但除非是活沙层里培养了大量的沙层生物，后来许多用过厚底沙过滤系统者却经历了沙层产生硫化氢气的问题。

自然系统（欧美混合）

北美的一群海水缸爱好者融合了几种过滤系统的优点在一起，成为最新崛起的自然系统。活礁石、活霰沙、充水层（可有可无）、强大的乱水流、高效率的蛋白质过滤器、强烈的灯光、添加石灰水（或运用钙质反应器），成功的养活了之前难以饲养的高难度珊瑚。

海藻/红树过滤

在底缸或另外设立一个和主缸水相通的海藻/红树过滤缸，是降低硝酸盐、磷酸盐、过剩溶养和重金属的有效方法
灯光

自然界的热带珊瑚礁长年有强烈的阳光照射，尤其是浅海地带。珊瑚与藻类则需要足够的光线起光合作用来制造食物。在我们的水族箱，其中有一些生物或藻类要靠光线生存与繁殖，有了充足光线这个条件才会给缸里的生物制造一个健康的环境与食物环。目前市场很难找到一种灯可以复制阳光，但是对那些需要强烈光线的生物来说当然越接近阳光当然是越好的。

简单的灯光计算法

高亮度的礁石缸 （浅海的鹿角珊瑚等） = 每加仑 8~10 瓦特
中等亮度的礁石缸（普通石珊瑚） = 每加仑 3~6 瓦特
低亮度的礁石缸（软体珊瑚） = 每加仑 1~2 瓦特
纯鱼缸 = 2~4盏荧光灯（根据水族箱的长度）

注：这只是对普通水族箱的大约计算法，不同高低的水深度或环境就要个别考虑

对珊瑚礁石系统来说，不同的珊瑚种类对光线的亮度和色温要求都有所不同。鱼的要求则比较简单，总的来说，来之深海的生物适合暗的蓝灯，来之浅海的适合亮的白灯。

色温

光线经过海水的过滤，因为蓝色的光波比其它颜色光波较短，可以透入水中最深，所以水面以下越深的水里就会剩下越多的蓝色光波。市场上适合海水缸的灯光色温有6,5000k（白）、10,000k（带蓝）、14,000k（蓝）与20,000k（紫蓝）。 k 数越高（因为蓝波越多的关系）灯光就会显得越暗。许多专家都建议混合不同色温的灯光，使缸里的各种不同生物都能受益。

灯类则是荧光灯与卤素灯的输出是比较适合海水缸使用。

水质

海水的成份不单是水和盐分，除了氯化物、硫酸盐、碳酸氢盐、溴化物、硼酸盐、氟化物、钠、镁、钙、钠、锶 11 种多量元素（占了海水内矿物质的99.9%）之外，其中还包含了超过 70 种的微量元素，在自然珊瑚礁区，水质清澈、干净、低溶养和没有污染成份。我们的水族箱也应该尽量维持良好的水质，才能保护缸里生物的健康和控制不好的藻类暴长。养少量的鱼、小量喂食、用高品质的粮食、少量多换水、时常清洗过滤棉等常务，都能帮助减缓水质污染，鱼可以适应较高的温度，珊瑚则不行。尽可能接近自然海域的温度和维持稳定，尤其是对珊瑚礁石系统。

海水系统水质维持读数；

比重 = 1.022~1.024 （纯鱼缸1.020~1.022）
温度 = 摄氏25~28度 （纯鱼缸可以再高1~2度）
酸碱度 = 8.0~8.4
碱性 = 8~12 dKH
钙 = 400~450 ppm
氨 = <0.25 ppm
亚硝酸盐 = <2.5 ppm
硝酸盐 = <30 ppm
磷酸盐 = <0.03 ppm
水量转次 = 每小时>5次

淡水的来源

如果不是用海水的话，开缸或换水就得要用淡水混合人工盐。每天添加蒸发失去的水份都要用到淡水。

在本地，淡水的来源通常是；自来水、井水或地下水，其中以自来水占最多。

自来水里都添加磷酸盐来保护输送管和加入氯或氯胺等药物杀菌。前者会导致藻类暴长，而且是不能使用药物来化解只能使用过滤器材吸取掉。后者这些成份对人类没有显著的影响，但对水族箱的生物来说是简直是立刻致命的****，还有金属自来水输送管日久会给水中带来重金属，单单化解氯的药物可以在市场上很容易以廉价买到，但是如果能够一起化解氨、氯和氯胺的药物，价钱就不便宜了。而且使用过少不能完全化解毒素，过量又会在水里余留着一些成份，对海水缸来说，建议将已经过药物处理的淡水，再用活性炭和吸取磷酸盐的器材过滤后才用。以免将不能完全化解的毒素、过剩的药物、重金属和磷酸盐在水中一起被加入缸里，处理自来水最好的方法就是使用 逆流渗透（RO）或离子（DI）过滤器。但是这两种过滤器都价钱昂贵，蒸馏水是纯水也可以用作少量的添加水。