体表

将病鱼置于白搪瓷盘中，按顺序从嘴、头部、鳃部、体表、鳍条仔细观察。寄生于体表的线虫、锚头鳋、鱼鲺、钩介幼虫、水霉等大型病原体，很容易被观察确定。但很多用肉眼看不出来的小型病原体，则主要根据表现出来的症状加以辨别，口丝虫、车轮虫、斜管虫、三代虫等引起的病状，一般会分泌大量粘液，有时微带污泥，或者是嘴、头以及鳍条末端腐烂，但鳍条基部一般不充血。疖疮病则表现为病变部位发炎、脓肿。白皮病病变部位发白，粘液少，用手摸有粗糙感。复口吸虫表现出眼球混浊，后期出现白内障。但有些病症，如鳍条基部充血和蛀鳍，则都是赤皮病、肠炎、烂鳃病以及其他一些细菌性鱼病的病症之一；大量的车轮虫、斜管虫、小瓜虫、指环虫等寄生虫寄生于鱼的体表或鳃上，同样都会刺激鱼体分泌较多的粘液。因此，除了根据病鱼症状，还应根据病原体的生活习性和条件、主要选择宿主等综合分析考虑。

鳃部

鳃检查鳃部，重点是鳃丝。先看鳃盖是否张开，然后用剪刀小心把鳃盖剪掉，观察鳃片上鳃丝是否肿大或腐烂，鳃的颜色是否正常，粘液是否增多等。如果是细菌性烂鳃病，则鳃丝末端腐烂，粘液较多；若是鳃霉病，则鳃片颜色发白，略带微红色小点；若是车轮虫、斜管虫、鳃隐鞭虫、指环虫、三代虫等寄生虫引起的鱼病，鳃片上则会有较多粘液；若是中华鳋、双身虫、狭腹鳋、粘孢子虫孢囊等寄生虫，则常表现为鳃丝肿大，鳃盖胀开等症状；小瓜虫、孢子虫大量寄生时，肉眼即可见大量白点，因此常被称为"白点病"。