检查病鱼时，要按一定顺序进行。原则上是从外到内，由表及里。先检查鱼体裸露部位，然后检查血液和脏器、组织。体表、鳃、肠道为必须检查部位。

(1)体表 目检头部、吻、口腔、眼和眼眶周围、鳃盖、躯干、鳞片、鳍、肛门、尾部等部位有无异常，是否有充血、发炎、溃疡、浮肿、斑痕、鳞片松弛甚至脱落、竖鳞、鳍缺损等征象。可检出一些大型寄生虫或孢囊。

刮取体表、鳍等部位的黏液，放在滴有清水的载玻片上，盖上盖玻片，做成玻片镜检，可发现致病性原虫、蠕虫等寄生虫。镜检时，应按先低倍后高倍的顺序观察、鉴别虫体。对初学者来说，可将观察到的活动虫体实物与书本上描绘的虫体图样作对照，提高自己鉴别病虫的能力。

(2)血液 从心脏取出血液滴一滴在载玻片上，或者将汲取的血液全部注入一培养皿中，再取与血清交界处的血液滴一滴在载玻片上，盖上盖玻片，可检出细菌、异常血细胞、寄生原虫、蠕虫等。

(3)鳃 目检鳃瓣是否完整，颜色有无异常，可检出小型孢囊、大型寄生虫或充血、褪色、肿大发白、腐烂蚀损等。剪下少许鳃丝放在玻片上(玻片上先滴一滴清水，海水鱼用煮沸或过滤海水，淡水鱼用煮沸后的开水)，用镊子或解剖针把鳃丝逐一分开，盖上载玻片镜检，可发现多种细菌、真菌、原虫、蠕虫和甲壳类等寄生虫。

(4)内部器官 外表检查完后，即可进行内部组织器官的槿查。方法是从肛门沿腹线和侧线剪开，除去一侧腹壁，露出整个冈脏。解剖时勿剪破胆囊，记录有无腹腔液及其浊度、颜色，有无万型寄生虫如线虫、绦虫、甲壳类和孢囊。观察各组织器官的体积大小、颜色深浅。从咽喉和靠肛门处剪断消化道，取出整个内脏，在解剖盘中小心分开剥离。按下列顺序镜检：心脏、膀胱、胆囊、肝脏、胰脏、睥脏、肾脏、肠系膜、胃肠道、性腺、气鳔、脂肪组织、脑、脊髓、肌肉等。也可根据临诊和目检所得，重点检查其中若干个部位。

胃肠道可从胃、前肠IS]后剪开，检查前中后三段。注意胃肠食物充盈情况，胃肠壁有无发炎、溃疡，肠内黏液的颜色和多寡，有无大型寄生虫或孢囊。然后刮取胃、肠壁黏液少许，放在加有生理盐水(浓度：淡水鱼用7％，海水鱼可用1％)的玻片上，盖上盖玻片镜检。其他脏器则可用压片法检查。检查所得，对疾病诊断很重要。