原问题：一个很有意思的问题：上面不是说了，在PH值比较低的水体中，不适合硝化细菌生活，那是不是说，在自然界那些比较酸或者是很酸的水域中，就没有硝化作用的发生了呢？我们使用水草泥的草缸，PH值经常在6.0以下，是不是也没有硝化作用了呢？如果没有硝化作用，那不断产生的硝酸盐是从哪里来的？还有，微酸性甚至是酸性的土壤中为什么会有硝酸盐？难道不是通过硝化作用产生的吗？

这个问题确实很能引起人们的兴趣，但要揭开这个谜底，还要从硝化作用的定义以及硝化作用的原料说起。硝化作用一般定义是硝化细菌把氨氧化为硝酸的过程。而对于硝化作用所采用原料的争论从来就没停止过，有说硝化细菌是以氨为原料的；也有说是以铵为原料的，这就导致了对于硝化细菌和硝化作用从理解上的相当混乱的局面。

要知道，PH值在6以下就没有分子态的氨存在于水体了，如果说硝化细菌是以氨为原料的，那么硝化作用的极限也就是PH值为6.0了，这自然无法解释本问题提出的现象。难道认为氨是硝化细菌进行硝化作用的原料这个看法错了？

我认为在科学研究的道路上不轻易否定一个结论和不轻易肯定一个结论是一样重要的，这应当成为每一个崇尚科学的人的共识，因为无论什么样的结论，都是经过长时间的实验、观察和思考得来的，它包含了研究人太多的辛勤和汗水，没有百分之百正确的结论也没有百分之百错误的结论。

硝化细菌是个广义的概念，它应当包括所有具有硝化作用能力的微生物，其中有自养型细菌、异养型细菌、真菌和放线菌等。而我们在水族养殖中最重要、最受关注的则是自养型细菌，也就是通常所说的“硝化细菌”，这是一大类细菌的统称而非是一种细菌的名字，它们最适宜的PH值是中性到弱碱性的环境，在这个PH范围内，水体中不乏氨的存在，故认为它们是以氨为“食物”是说得过去的。那么，在黑水河呢？在一些酸性很强的水域呢？难道真没有硝化作用了吗？事实并非如此，对于酸性水体中硝化作用的研究不是很多，但是对于酸性土壤的硝化作用的研究却并不少见，有学者提出硝化作用的PH值范围是5.5~10.0，有报导PH值为4.5时就已经能发生硝化作用，甚至有PH值为3.8的土壤中发生硝化作用的报导，由此不由得让人感叹大自然的奇妙与伟大，很多生物都能在适合自己的环境中占有一席之地并为整个生态平衡默默地付出着。

总之，广义的硝化细菌并不限定在我们司空见惯的那几个种类，它包含了一切可进行硝化作用的微生物，是个很庞大的生物群体，物种的多元化一定会导致其“食物”的多元化，不仅包括氨、铵甚至还有胺、酰胺、羟胺、肟和很多还原态氮化合物。